Tsukuba se situe au nord-est de Tokyo, à environ 50 km. Dotée d’une superficie d’environ 29 000 hectares, soit la moitié de la taille des 23 arrondissements de Tokyo, elle compte près de 200 000 habitants.
Les échanges entre Shenzhen et Tsukuba ont commencé dès 1992, et les deux villes ont signé officiellement un accord de jumelage le 9 juin 2004.